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PCR实验的污染来源都有哪些?

PCR实验的污染来源都有哪些?

样本间交叉污染:收集样本的容器被污染或样本密封不严导致外溢;不同样本移液时忘记更换枪尖或未使用带滤芯枪尖;移液器等实验器具及耗材未及时消毒灭菌;不同样本同时开盖或样本剧烈震荡、反复吹吸导致气溶胶形成扩散,相互交叉污染。

实验试剂污染:主要是在 PCR 组分试剂加样过程中,由于移液器、容器、阴性对照及其它试剂被核酸模板或阳性对照污染。加样过程中,因为PCR试剂对温度十分敏感,需要通过冰浴使得PCR试剂和PCR板/管处于0℃,但这个过程也充满污染风险。

扩增产物污染:大量拷贝的产物泄漏或扩增后的PCR反应管意外开盖,这是PCR反应中最主要、最常见的污染问题。因为PCR产物拷贝量大,远远高于PCR检测数个拷贝的极限,所以极微量的PCR产物污染,就可形成假阳性。

那么对于【细胞和生物制品】及其生产过程中【支原体】污染的检测,有什么PCR检测方法吗?

  • 常规PCR Kit (经典法)(不含Taq酶)

特点

1.内控对照为独立包装,遵循欧洲药典和日本药典操作流程。

2.高特异性,仅一条阳性对照条带,即可涵盖所有可能感染细胞的支原体物种。操作简单,

易于观察。

3. 高灵敏度,若PCR反应体系加入10μl样本,支原体检测限度为≤5或≤10CFU。

操作步骤

第1步:样本处理

a. 细胞培养上清

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b. 生物药或需遵循药典的样本

说明:①样品基质可能会影响检测的灵敏度。收集和筛选更高的样品量可提高测定灵敏度。

②细胞培养物样本含丰富的DNA酶,在低温下也能降解支原DNA,影响检测灵敏度。

建议:样本做DNA抽提处理,实现最高灵敏度。

推荐:德国MB公司生产的专用支原体DNA提取试剂盒,Venor® Gem Sample Preparation Kit。该DNA抽提试 剂盒已经过广泛验证。

第2步:试剂制备

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第3步:PCR体系建立

a. 细胞培养上清

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b. 生物药或需遵循药典的样本

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第4步:启动PCR反应

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第5步:电泳结果分析

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191bp为内控对照条带,表明PCR反应正常。

当样本存在支原体污染时,由于内控对照与支原体DNA存在竞争,内控对照条带变弱(例如支原体DNA>103拷贝)。

阳性对照中支原体DNA>104拷贝,内控对照条带会完全消失。

可能在80-90bp存在引物自退火形成的条带,此条带不影响检测结果。

如果待测样本对PCR产生抑制,则内控对照条带变弱(和阴性对照相比),此时应先进行DNA抽提,然后再检测。

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以上内容来源网络


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